Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EEFSECP57772 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms