Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASP7P55210 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASP7P55210 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASP7P55210 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP7P55210 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP7P55210 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP7P55210 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP7P55210 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP7P55210 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP7P55210 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP7P55210 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP7P55210 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP7P55210 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP7P55210 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP7P55210 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP7P55210 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASP7P55210 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASP7P55210 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASP7P55210 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASP7P55210 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASP7P55210 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASP7P55210 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CASP7P55210 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASP7P55210 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP7P55210 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP7P55210 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP7P55210 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP7P55210 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP7P55210 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP7P55210 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP7P55210 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP7P55210 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP7P55210 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP7P55210 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASP7P55210 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms