Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSBP53539 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSBP53539 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSBP53539 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSBP53539 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSBP53539 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSBP53539 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSBP53539 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSBP53539 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSBP53539 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSBP53539 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSBP53539 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOSBP53539 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSBP53539 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSBP53539 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSBP53539 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSBP53539 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSBP53539 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSBP53539 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSBP53539 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSBP53539 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSBP53539 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSBP53539 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSBP53539 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSBP53539 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOSBP53539 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOSBP53539 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSBP53539 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSBP53539 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSBP53539 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSBP53539 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSBP53539 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSBP53539 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSBP53539 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSBP53539 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSBP53539 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSBP53539 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOSBP53539 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOSBP53539 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOSBP53539 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOSBP53539 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOSBP53539 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOSBP53539 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOSBP53539 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOSBP53539 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms