Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRE11P49959 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRE11P49959 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRE11P49959 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRE11P49959 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRE11P49959 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MRE11P49959 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MRE11P49959 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRE11P49959 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRE11P49959 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRE11P49959 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRE11P49959 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRE11P49959 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MRE11P49959 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MRE11P49959 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MRE11P49959 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MRE11P49959 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRE11P49959 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRE11P49959 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRE11P49959 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRE11P49959 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRE11P49959 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRE11P49959 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MRE11P49959 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRE11P49959 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRE11P49959 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRE11P49959 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRE11P49959 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRE11P49959 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRE11P49959 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRE11P49959 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MRE11P49959 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MRE11P49959 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MRE11P49959 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms