Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTBP49356 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTBP49356 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTBP49356 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTBP49356 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTBP49356 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTBP49356 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTBP49356 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTBP49356 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTBP49356 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FNTBP49356 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTBP49356 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTBP49356 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTBP49356 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTBP49356 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTBP49356 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTBP49356 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTBP49356 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FNTBP49356 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FNTBP49356 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FNTBP49356 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FNTBP49356 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FNTBP49356 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms