Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLCP48506 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLCP48506 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCLCP48506 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCLCP48506 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCLCP48506 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCLCP48506 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GCLCP48506 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCLCP48506 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GCLCP48506 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GCLCP48506 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCLCP48506 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLCP48506 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLCP48506 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLCP48506 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLCP48506 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLCP48506 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLCP48506 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLCP48506 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLCP48506 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLCP48506 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLCP48506 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLCP48506 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLCP48506 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLCP48506 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLCP48506 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLCP48506 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLCP48506 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLCP48506 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLCP48506 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLCP48506 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLCP48506 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLCP48506 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLCP48506 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLCP48506 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLCP48506 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLCP48506 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLCP48506 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLCP48506 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLCP48506 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GCLCP48506 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLCP48506 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLCP48506 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLCP48506 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLCP48506 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms