Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJA8P48165 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJA8P48165 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA8P48165 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJA8P48165 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA8P48165 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA8P48165 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA8P48165 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA8P48165 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA8P48165 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA8P48165 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA8P48165 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA8P48165 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA8P48165 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA8P48165 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA8P48165 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJA8P48165 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA8P48165 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA8P48165 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA8P48165 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA8P48165 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA8P48165 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA8P48165 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA8P48165 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA8P48165 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA8P48165 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms