Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABRB2P47870 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GABRB2P47870 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms