Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
MAP2K4P45985 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MAP2K4P45985 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms