Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR4A2P43354 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NR4A2P43354 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms