Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAPGP40121 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAPGP40121 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CAPGP40121 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CAPGP40121 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPGP40121 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPGP40121 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPGP40121 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPGP40121 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPGP40121 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPGP40121 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPGP40121 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPGP40121 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPGP40121 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPGP40121 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPGP40121 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPGP40121 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms