Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LIPAP38571 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LIPAP38571 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LIPAP38571 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LIPAP38571 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms