Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBRP36941 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBRP36941 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBRP36941 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBRP36941 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBRP36941 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBRP36941 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LTBRP36941 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBRP36941 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBRP36941 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBRP36941 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBRP36941 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBRP36941 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBRP36941 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBRP36941 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBRP36941 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBRP36941 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBRP36941 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBRP36941 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBRP36941 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBRP36941 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LTBRP36941 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LTBRP36941 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBRP36941 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBRP36941 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBRP36941 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBRP36941 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBRP36941 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBRP36941 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBRP36941 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBRP36941 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBRP36941 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBRP36941 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBRP36941 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBRP36941 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LTBRP36941 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBRP36941 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBRP36941 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBRP36941 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBRP36941 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBRP36941 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBRP36941 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBRP36941 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBRP36941 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBRP36941 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBRP36941 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBRP36941 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBRP36941 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBRP36941 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBRP36941 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LTBRP36941 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LTBRP36941 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LTBRP36941 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LTBRP36941 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LTBRP36941 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LTBRP36941 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LTBRP36941 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms