Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP5C1P36542 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ATP5C1P36542 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms