Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DSG3P32926 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DSG3P32926 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DSG3P32926 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DSG3P32926 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DSG3P32926 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSG3P32926 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSG3P32926 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSG3P32926 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSG3P32926 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSG3P32926 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSG3P32926 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DSG3P32926 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG3P32926 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG3P32926 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG3P32926 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG3P32926 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG3P32926 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG3P32926 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG3P32926 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSG3P32926 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG3P32926 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG3P32926 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG3P32926 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG3P32926 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG3P32926 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG3P32926 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG3P32926 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG3P32926 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG3P32926 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSG3P32926 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSG3P32926 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms