Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 YAR009CYAR009C 3591 nt1.2□□□□□ -2.22
NDI1P32340 STO1YMR125W 2586 nt1.2□□□□□ -2.22
NDI1P32340 snR80snR80 171 nt1.19□□□□□ -2.22
NDI1P32340 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.19□□□□□ -2.22
NDI1P32340 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.19□□□□□ -2.22
NDI1P32340 snR74snR74 88 nt1.18□□□□□ -2.22
NDI1P32340 ABF2YMR072W 552 nt1.18□□□□□ -2.22
NDI1P32340 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.18□□□□□ -2.22
NDI1P32340 MCM10YIL150C 1716 nt1.18□□□□□ -2.22
NDI1P32340 snR55snR55 98 nt1.17□□□□□ -2.22
NDI1P32340 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.17□□□□□ -2.22
NDI1P32340 ECM12YHR021W-A 456 nt1.17□□□□□ -2.22
NDI1P32340 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.17□□□□□ -2.22
NDI1P32340 IML1YJR138W 4755 nt1.16□□□□□ -2.22
NDI1P32340 SGF11YPL047W 300 nt1.16□□□□□ -2.22
NDI1P32340 SIP4YJL089W 2490 nt1.16□□□□□ -2.22
NDI1P32340 EAF1YDR359C 2949 nt1.16□□□□□ -2.22
NDI1P32340 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt1.15□□□□□ -2.23
NDI1P32340 NUP145YGL092W 3954 nt1.15□□□□□ -2.23
NDI1P32340 STB6YKL072W 2301 nt1.15□□□□□ -2.23
NDI1P32340 NPR2YEL062W 1848 nt1.15□□□□□ -2.23
NDI1P32340 YJR029WYJR029W 5268 nt1.14□□□□□ -2.23
NDI1P32340 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.14□□□□□ -2.23
NDI1P32340 SEC3YER008C 4011 nt1.13□□□□□ -2.23
NDI1P32340 SPT7YBR081C 3999 nt1.13□□□□□ -2.23
NDI1P32340 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.12□□□□□ -2.23
NDI1P32340 WAR1YML076C 2835 nt1.12□□□□□ -2.23
NDI1P32340 OLI1Q0130 231 nt1.11□□□□□ -2.23
NDI1P32340 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.11□□□□□ -2.23
NDI1P32340 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.11□□□□□ -2.23
NDI1P32340 TTI1YKL033W 3117 nt1.11□□□□□ -2.23
NDI1P32340 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.1□□□□□ -2.23
NDI1P32340 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.1□□□□□ -2.23
NDI1P32340 APL1YJR005W 2103 nt1.09□□□□□ -2.23
NDI1P32340 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.09□□□□□ -2.23
NDI1P32340 YNL211CYNL211C 261 nt1.08□□□□□ -2.24
NDI1P32340 YOR302WYOR302W 78 nt1.08□□□□□ -2.24
NDI1P32340 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.08□□□□□ -2.24
NDI1P32340 NUP157YER105C 4176 nt1.08□□□□□ -2.24
NDI1P32340 YKU70YMR284W 1809 nt1.08□□□□□ -2.24
NDI1P32340 VAM6YDL077C 3150 nt1.07□□□□□ -2.24
NDI1P32340 NST1YNL091W 3723 nt1.07□□□□□ -2.24
NDI1P32340 GEA2YEL022W 4380 nt1.07□□□□□ -2.24
NDI1P32340 SMC1YFL008W 3678 nt1.07□□□□□ -2.24
NDI1P32340 YDL196WYDL196W 330 nt1.06□□□□□ -2.24
NDI1P32340 BEM2YER155C 6504 nt1.05□□□□□ -2.24
NDI1P32340 CMC4YMR194C-B 222 nt1.04□□□□□ -2.24
NDI1P32340 NOP9YJL010C 2001 nt1.04□□□□□ -2.24
NDI1P32340 CLU1YMR012W 3834 nt1.03□□□□□ -2.24
NDI1P32340 SPG3YDR504C 384 nt1.03□□□□□ -2.24
NDI1P32340 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.03□□□□□ -2.24
NDI1P32340 ROM2YLR371W 4071 nt1.02□□□□□ -2.25
NDI1P32340 PAA1YDR071C 576 nt1.02□□□□□ -2.25
NDI1P32340 ISD11YER048W-A 285 nt1.01□□□□□ -2.25
NDI1P32340 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.01□□□□□ -2.25
NDI1P32340 JLP2YMR132C 627 nt1.01□□□□□ -2.25
NDI1P32340 BUD3YCL014W 4911 nt1.01□□□□□ -2.25
NDI1P32340 YOR345CYOR345C 351 nt1□□□□□ -2.25
NDI1P32340 YPL044CYPL044C 549 nt1□□□□□ -2.25
NDI1P32340 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1□□□□□ -2.25
NDI1P32340 ASE1YOR058C 2658 nt1□□□□□ -2.25
NDI1P32340 KAP120YPL125W 3099 nt1□□□□□ -2.25
NDI1P32340 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.99□□□□□ -2.25
NDI1P32340 APQ12YIL040W 417 nt0.99□□□□□ -2.25
NDI1P32340 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.98□□□□□ -2.25
NDI1P32340 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.98□□□□□ -2.25
NDI1P32340 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.98□□□□□ -2.25
NDI1P32340 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.98□□□□□ -2.25
NDI1P32340 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.98□□□□□ -2.25
NDI1P32340 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt0.98□□□□□ -2.25
NDI1P32340 ULI1YFR026C 510 nt0.97□□□□□ -2.25
NDI1P32340 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.97□□□□□ -2.25
NDI1P32340 RPS30BYOR182C 192 nt0.97□□□□□ -2.25
NDI1P32340 BLI1YKL061W 342 nt0.96□□□□□ -2.26
NDI1P32340 SCC2YDR180W 4482 nt0.95□□□□□ -2.26
NDI1P32340 RPL26BYGR034W 384 nt0.95□□□□□ -2.26
NDI1P32340 COX12YLR038C 252 nt0.95□□□□□ -2.26
NDI1P32340 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.95□□□□□ -2.26
NDI1P32340 UBP3YER151C 2739 nt0.95□□□□□ -2.26
NDI1P32340 COY1YKL179C 2040 nt0.94□□□□□ -2.26
NDI1P32340 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.94□□□□□ -2.26
NDI1P32340 PAM16YJL104W 450 nt0.94□□□□□ -2.26
NDI1P32340 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.93□□□□□ -2.26
NDI1P32340 BFR2YDR299W 1605 nt0.93□□□□□ -2.26
NDI1P32340 HAL9YOL089C 3093 nt0.92□□□□□ -2.26
NDI1P32340 YPR117WYPR117W 7470 nt0.92□□□□□ -2.26
NDI1P32340 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.92□□□□□ -2.26
NDI1P32340 DOP1YDR141C 5097 nt0.92□□□□□ -2.26
NDI1P32340 PMP1YCR024C-A 123 nt0.91□□□□□ -2.26
NDI1P32340 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.91□□□□□ -2.26
NDI1P32340 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.91□□□□□ -2.26
NDI1P32340 YLR282CYLR282C 342 nt0.91□□□□□ -2.26
NDI1P32340 snR190snR190 190 nt0.91□□□□□ -2.26
NDI1P32340 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.9□□□□□ -2.27
NDI1P32340 STF2YGR008C 255 nt0.9□□□□□ -2.27
NDI1P32340 PAU24YBR301W 363 nt0.89□□□□□ -2.27
NDI1P32340 PRP16YKR086W 3216 nt0.89□□□□□ -2.27
NDI1P32340 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.88□□□□□ -2.27
NDI1P32340 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.88□□□□□ -2.27
NDI1P32340 COX5BYIL111W 456 nt0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.5 ms