Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKARP32238 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKARP32238 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKARP32238 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKARP32238 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKARP32238 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKARP32238 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKARP32238 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKARP32238 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKARP32238 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKARP32238 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKARP32238 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCKARP32238 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCKARP32238 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCKARP32238 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms