Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VAMP1P23763 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms