Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PTPRBP23467 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRBP23467 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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