Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CD58P19256 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD58P19256 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD58P19256 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD58P19256 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD58P19256 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD58P19256 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD58P19256 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD58P19256 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD58P19256 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD58P19256 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD58P19256 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD58P19256 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD58P19256 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD58P19256 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD58P19256 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD58P19256 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD58P19256 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD58P19256 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD58P19256 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD58P19256 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CD58P19256 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD58P19256 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD58P19256 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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