Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRAP18433 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms