Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZKSCAN1P17029 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZKSCAN1P17029 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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