Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSPT1P15170 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSPT1P15170 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms