Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFTRP13569 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFTRP13569 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CFTRP13569 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CFTRP13569 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CFTRP13569 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CFTRP13569 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CFTRP13569 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CFTRP13569 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CFTRP13569 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CFTRP13569 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CFTRP13569 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFTRP13569 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFTRP13569 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFTRP13569 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
CFTRP13569 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CFTRP13569 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CFTRP13569 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CFTRP13569 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CFTRP13569 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CFTRP13569 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CFTRP13569 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CFTRP13569 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CFTRP13569 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CFTRP13569 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFTRP13569 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CFTRP13569 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFTRP13569 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFTRP13569 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFTRP13569 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFTRP13569 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFTRP13569 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFTRP13569 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFTRP13569 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFTRP13569 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFTRP13569 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CFTRP13569 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFTRP13569 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFTRP13569 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFTRP13569 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CFTRP13569 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFTRP13569 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CFTRP13569 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFTRP13569 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFTRP13569 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFTRP13569 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFTRP13569 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFTRP13569 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CFTRP13569 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CFTRP13569 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CFTRP13569 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFTRP13569 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFTRP13569 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFTRP13569 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFTRP13569 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFTRP13569 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFTRP13569 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CFTRP13569 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CFTRP13569 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFTRP13569 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFTRP13569 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFTRP13569 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFTRP13569 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFTRP13569 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CFTRP13569 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFTRP13569 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFTRP13569 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFTRP13569 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFTRP13569 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFTRP13569 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CFTRP13569 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CFTRP13569 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFTRP13569 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFTRP13569 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFTRP13569 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFTRP13569 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFTRP13569 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFTRP13569 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFTRP13569 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CFTRP13569 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CFTRP13569 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.3 ms