Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCF2P10911 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCF2P10911 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MCF2P10911 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCF2P10911 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MCF2P10911 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCF2P10911 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms