Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RD3LP0DJH9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms