Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBB4AP04350 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB4AP04350 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms