Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC3P02656 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC3P02656 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOC3P02656 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOC3P02656 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC3P02656 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOC3P02656 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOC3P02656 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms