Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA1P02647 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA1P02647 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA1P02647 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA1P02647 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA1P02647 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA1P02647 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA1P02647 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA1P02647 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOA1P02647 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOA1P02647 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOA1P02647 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOA1P02647 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA1P02647 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA1P02647 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA1P02647 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA1P02647 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA1P02647 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA1P02647 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA1P02647 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA1P02647 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA1P02647 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA1P02647 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA1P02647 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA1P02647 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA1P02647 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOA1P02647 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms