Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOSP01100 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSP01100 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSP01100 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSP01100 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSP01100 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSP01100 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSP01100 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSP01100 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSP01100 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSP01100 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSP01100 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSP01100 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSP01100 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSP01100 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOSP01100 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSP01100 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSP01100 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSP01100 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSP01100 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSP01100 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSP01100 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSP01100 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSP01100 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSP01100 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSP01100 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSP01100 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSP01100 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSP01100 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSP01100 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOSP01100 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSP01100 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSP01100 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSP01100 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSP01100 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSP01100 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSP01100 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSP01100 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSP01100 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSP01100 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSP01100 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSP01100 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOSP01100 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOSP01100 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOSP01100 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FOSP01100 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOSP01100 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSP01100 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSP01100 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSP01100 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSP01100 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSP01100 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSP01100 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSP01100 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSP01100 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSP01100 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSP01100 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSP01100 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSP01100 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSP01100 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FOSP01100 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms