Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ZNF253O75346 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF253O75346 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms