Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIA3O75145 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIA3O75145 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms