Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNT1O60563 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNT1O60563 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms