Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PLXNC1O60486 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLXNC1O60486 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms