Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BNIP3LO60238 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms