Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LANCL1O43813 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms