Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA2O43364 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXA2O43364 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms