Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEFVO15553 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEFVO15553 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEFVO15553 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEFVO15553 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MEFVO15553 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MEFVO15553 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MEFVO15553 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MEFVO15553 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MEFVO15553 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MEFVO15553 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MEFVO15553 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MEFVO15553 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MEFVO15553 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEFVO15553 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEFVO15553 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEFVO15553 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEFVO15553 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEFVO15553 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEFVO15553 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEFVO15553 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEFVO15553 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEFVO15553 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEFVO15553 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEFVO15553 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEFVO15553 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEFVO15553 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MEFVO15553 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms