Protein–RNA interactions for Protein: O14787

TNPO2, Transportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO2O14787 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNPO2O14787 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNPO2O14787 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms