Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX7O00628 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX7O00628 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PEX7O00628 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PEX7O00628 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms