Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLRMTO00411 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLRMTO00411 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms