Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP17L21D6R901 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP17L21D6R901 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms