Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ODF3BA8MYP8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ODF3BA8MYP8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms