Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
SSPOA2VEC9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
SSPOA2VEC9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms