Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC78A2IDD5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC78A2IDD5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms