Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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