Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0D9SFI3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A0D9SFI3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms