Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 SEM1-215ENST00000615352 2637 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 GLDN-202ENST00000396399 4584 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC025822.2-201ENST00000455199 2287 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 ARHGEF9-201ENST00000253401 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC073842.1-201ENST00000376482 342 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL772337.3-201ENST00000447524 452 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AC007611.1-202ENST00000564212 854 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 ATG13-201ENST00000359513 4348 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 BTK-210ENST00000621635 2767 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
POLR2AP24928 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 SEC23IP-208ENST00000543134 1461 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CDH23-203ENST00000398788 4329 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ZNF546-207ENST00000600094 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CYP4A11-201ENST00000310638 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ABLIM3-207ENST00000508983 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 LINC01915-201ENST00000577994 2321 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 PTPRM-203ENST00000400060 5030 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 RPL5P8-201ENST00000396820 815 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 SDHCP4-201ENST00000532834 510 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 MASP1-203ENST00000337774 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 NELL2-217ENST00000551601 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CSTF2T-201ENST00000331173 4105 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AGBL4-203ENST00000371838 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AIM2-202ENST00000368130 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ADCY10P1-203ENST00000567255 4569 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CHODL-206ENST00000400135 2136 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 RFT1-201ENST00000296292 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ZNF217-201ENST00000302342 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 PRICKLE2-AS2-201ENST00000484703 496 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 OR4A7P-201ENST00000531463 910 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 OAT-208ENST00000539214 1864 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC005863.1-201ENST00000379640 2998 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ICA1L-202ENST00000392237 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 SH3YL1-202ENST00000402632 3151 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AC114980.1-201ENST00000505668 3157 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 SLC16A12-201ENST00000371790 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 CTNNA2-201ENST00000343114 2927 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
POLR2AP24928 AL136146.1-201ENST00000529830 1667 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms