Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 CRYAB-203ENST00000525823 915 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AP000873.3-201ENST00000531869 766 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 CRYAB-212ENST00000533280 545 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 SAA3P-202ENST00000534768 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 FLVCR2-202ENST00000539311 1221 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC016954.1-201ENST00000549976 745 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 OR11J5P-201ENST00000556889 934 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 OR4N3P-201ENST00000559395 818 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 VN1R65P-201ENST00000566443 808 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AP001178.2-201ENST00000580007 326 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC087289.3-203ENST00000587556 550 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC135068.4-201ENST00000622949 925 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC016542.3-201ENST00000623520 619 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 PGAM1P5-203ENST00000626376 313 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 TMEM182-211ENST00000640575 1155 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 NCAPH-202ENST00000427946 2363 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 SPATA22-209ENST00000572969 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 ERAP2-201ENST00000379904 3219 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 ENTPD1-AS1-211ENST00000454638 2933 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 FRG2-201ENST00000378763 2084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CSPP1Q1MSJ5 OR2T6-201ENST00000355728 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AURKA-205ENST00000395911 2145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 CNN2P7-201ENST00000400583 932 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 OR51A8P-201ENST00000421277 940 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 RPL12P14-201ENST00000431782 490 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 DSCR10-201ENST00000432141 860 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PCBP1-AS1-233ENST00000442326 668 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AP1B1P1-202ENST00000448124 191 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AL450023.2-201ENST00000453276 545 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL749P-201ENST00000460421 290 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 OR9A3P-202ENST00000485185 878 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC092943.1-201ENST00000485389 878 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 PAX8-211ENST00000497038 816 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC023886.1-201ENST00000506057 685 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC097522.1-201ENST00000507811 1042 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 FOXG1-AS1-201ENST00000546560 538 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC009139.1-201ENST00000561672 652 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LINC02124-201ENST00000570087 484 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 GPC6-202ENST00000617456 792 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.108-201ENST00000621610 300 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AQP4-AS1-206ENST00000628174 919 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 OR51A8P-202ENST00000641606 1038 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 NGDN-201ENST00000397154 2204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 RPS6-204ENST00000380394 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 LCLAT1-201ENST00000309052 5060 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CSPP1Q1MSJ5 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms