Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNX8Q9Y5X2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms